ثريد عن ال bioinformatics
هو علم يجمع بين علوم الحاسب والبيانات الحيوية مثل الحمض النووي، والبروتينات
طيب نجي اول شي للاساسيات
DNA : هو مجموعة النيكوليوتيدات A , C , G , T
وتكون سلسلة جدا طويلة x.com
هو علم يجمع بين علوم الحاسب والبيانات الحيوية مثل الحمض النووي، والبروتينات
طيب نجي اول شي للاساسيات
DNA : هو مجموعة النيكوليوتيدات A , C , G , T
وتكون سلسلة جدا طويلة x.com
Gene: هو جزء من ال DNA بينتج لنا RNA او بروتين
None-coding Gene: هذي اجزاء من ال DNA , لاتنتج بروتين
عدد جينات الانسان مايقارب 19,800 الف جين فقط
واغلب جينات الانسان هي none-coding genes
ذكرت هذي المعلومات لان احنا بنشتغل على جينات الي كما ذكرنا بتنتج لنا بروتين ،
None-coding Gene: هذي اجزاء من ال DNA , لاتنتج بروتين
عدد جينات الانسان مايقارب 19,800 الف جين فقط
واغلب جينات الانسان هي none-coding genes
ذكرت هذي المعلومات لان احنا بنشتغل على جينات الي كما ذكرنا بتنتج لنا بروتين ،
طيب بنعرف اول شي معنى طفرة جينية:
هو تغير بالDNA sequences ادى ل تغير بالبروتين الناتج ويكون بسبب خطاء اثناء عملية replicattion , او خطاء ب DNA repair , او خطاء بسبب ال DNA recombination
هو تغير بالDNA sequences ادى ل تغير بالبروتين الناتج ويكون بسبب خطاء اثناء عملية replicattion , او خطاء ب DNA repair , او خطاء بسبب ال DNA recombination
ممكن هذا الطفره تكون بسبب تغير نيكليتيده واحدة او اكثر
وهذا التغير بياثر على وظائف البروتين المنتج من هذا الجين وقد يكون ممرض
وهذا التغير بياثر على وظائف البروتين المنتج من هذا الجين وقد يكون ممرض
الان مثلا عندنا مريض ب Cystic fibrosis وهو مرض جيني يؤثر على الوظائف التنفسية ، الهضم ، والجهاز التناسلي للرجل
احد اهم الاسباب هذي تكون بسبب طفرة اسمها F508del وغيرها من الطفرات.
احد اهم الاسباب هذي تكون بسبب طفرة اسمها F508del وغيرها من الطفرات.
كيف ممكن نوظف ال Bioinformatics على هذا الجين
ناخذ العينة من المريض نستخلص ال total RNA, بعدها نحوله لcDNA ,بعدها نسوي PCR عشان نحدد الجين الي نبغاه عن طريق البرايمرز واخيرا نسوي له Sequencing
القرائات بتجي على شكل احرف الي هي A, T ,C, G
ممكن توصل صفحات حسب طول الجين 👇🏻 x.com
ناخذ العينة من المريض نستخلص ال total RNA, بعدها نحوله لcDNA ,بعدها نسوي PCR عشان نحدد الجين الي نبغاه عن طريق البرايمرز واخيرا نسوي له Sequencing
القرائات بتجي على شكل احرف الي هي A, T ,C, G
ممكن توصل صفحات حسب طول الجين 👇🏻 x.com
بناخذ هذي القرائات ونحولها لبروتين ، زي ما احنا عارفين كل ٣ نيوكليوتيدات بتعطينا حمض اميني واحد
بنستخدم موقع Expasy او اي موقع ل translation
وطريقة عملها ببساطة ان كل ٣ نيوكليتيدات بترتيب معين بتعطينا حمض اميني معين
تطلع لنا بهالصورة كمثال x.com
بنستخدم موقع Expasy او اي موقع ل translation
وطريقة عملها ببساطة ان كل ٣ نيوكليتيدات بترتيب معين بتعطينا حمض اميني معين
تطلع لنا بهالصورة كمثال x.com
ليش حولناها لبروتين ؟ عشان نشوف التغير الي صار على ال DNA sequences, وادت الى تغير ب بال amino acids بالتالي بيكون هنا في تاثير ب البروتين ويكون غالبا مسبب للمرض
بعد ماخلصنا من هذي الخطوة والان عندنا amino acid sequence
بعد ماخلصنا من هذي الخطوة والان عندنا amino acid sequence
نقدر نسوي لها مطابقة مع amino acid sequence الطبيعي الناتج من هذا الجين
اختصارها aa
هذي الخطوة راح تخلينا نعرف الاماكن الي فيها تطابق او اختلاف او حتى مسح لجزء من الجين
اختصارها aa
هذي الخطوة راح تخلينا نعرف الاماكن الي فيها تطابق او اختلاف او حتى مسح لجزء من الجين
بالصوره هذي عندنا two sequences ، الصف الاول للسليم والي تحته لعينة المريض
علامه * يعني تطابق بين ال Amino Acid
وعلامة - يعني صار في deletion x.com
علامه * يعني تطابق بين ال Amino Acid
وعلامة - يعني صار في deletion x.com
جاري تحميل الاقتراحات...