حمود بن مقبل السبيعي - Homood
حمود بن مقبل السبيعي - Homood

@hassobeai

8 تغريدة 6 قراءة Dec 17, 2020
هذا الثريد .. امتداد لتغريدات سابقة لي تتحدث عن hidden treasure متوفرة مجانا على الانترنت للباحثين والمتخصين في أمراض السرطان التي من خلها تستطيع الحصول على نتائج بحثية تدعم بحثك أو تشجع للعمل على فكرة بحثية جديدة واعدة
ualcan.path.uab.edu
من المواقع المفضله لي مؤخرا .. لا يكاد أسبوع يمر الا وانا مطلع وباحث فيه .. هو عبادرة عن قاعدة بيانات ضخمه للنشاط الجيني و البروتيني في انواع مختلفة من السرطانات ومأخوذة مباشرة من الالاف المرضى..به خيارات كثيرة جدا تستطيع التحكم بها بناء على فكرتك البحثية
كمثال فقط: بحثت عن KRAS أحد أشهر oncogenes ونشاطه في سرطان الثدي .. في الصورة يحدد لك الخيارات التي تستطيع البحث عنها المتعلقة بالجين ..
اخترت نشاط الجين expression .. ظهر لي مقارنه بين عينات مأخوذه من أورام ثدي و أخرى طبيعيه .. لاحظ عدد العينات .. 1097 عينه في مجموعة الأورام .. هذا الرقم تحتاج سنوات و مراكز بحثية متعدده للحصول عليه بينما هنا .. احتجت فقط ثواني!
كما ذكرت هناك خيارات متعددة تستطيع الإبحار فيها و تظهر لك النتائج بناء عليها .. في الصوره الأولى اخترت مثلا خيار مراحل الأورام بناء على التشخيص .. في الصورة الثانيه الخيارات المتاحة التي تستطيع تقسيم المرضى بناء عليها
طبعا لا تخلوا أي قاعدة بيانات من سلبيات .. احد اهمها انك لا تستطيع النظر في اي عامل غير موجود و محدد لك سابقا .. العدد المرضى قليل لانواع معينه للسرطانات .. سرطانات معينه غير متوفرة اصلا ..
أحد الحلول التي تعطيك حرية أكبر هو انك تستطيع تحميل البيانات الاصلية للمرضى وهي اصلا تابعه لمشاريع بحثية ضخمه مثل TCGA و MET500 و متاحه مجانا عبر الانترنت .. تحتاج لمهارات تحليلها عن طريق انظمه مثل Linux أو لغات برمجة مثل R language
في النهاية .. مع وجود الكميات الضخمة من البيانات الجينيه لأمراض السرطان متاحه مجانا أصبحت هي المكان الأول لإجراء التجارب الأولية التي من خلالها تستطيع التحقق من افكار بحثية أولية غير ناضجه وتمحيصها قبل الانتقال للمعمل التقليدي .. بهذه الطريقة تستطيع توفر مجهودك/وقتك/مالك

جاري تحميل الاقتراحات...