راح نتكلم في هذه السلسلة عن البرايمرات كيف نصنعها وماهي الطرق المتاحة لشرائها بداية ماهو Primer؟ يسمى بالعربي البادئ وهو احد المكونات الاساسية لبدء اختبار
real time PCR or PCR والبرايمر يتكون من اتجاهين Forward و Reverse ويكون طوله 18-25 نيكلوتيد(١)
real time PCR or PCR والبرايمر يتكون من اتجاهين Forward و Reverse ويكون طوله 18-25 نيكلوتيد(١)
اذا نبي نستخد برايمر قدامنا خيارين , الخيار الاول : ان احنا نستخدم برايمر تم العمل عليه مسبقاَ ومنشور في ورقة علميه او موقع موثوق, ومثال على ذلك لو عندي فايروس مثلا #فيروس_كورونا_المستجدّ اولاً بحدد الجين اللي بشتغل عليه لو قلنا مثلا الجين N (٢)
راح ابحث مثلا في PUBMED pubmed.ncbi.nlm.nih.govوبكتب في البحث covid19 primer
الان ظهرت معي هالورقة العلمية ( كما في الصورة) لاحظ ان البرايمر ظاهر معي اللي هى بداية ‘5 الى’3 للجين المطلوب، الطريقة الثانية اني انا اللي اصنع البرايمر وهنا اكثر من موقع يقدم هالخدمة وانا بختار (٣)
الان ظهرت معي هالورقة العلمية ( كما في الصورة) لاحظ ان البرايمر ظاهر معي اللي هى بداية ‘5 الى’3 للجين المطلوب، الطريقة الثانية اني انا اللي اصنع البرايمر وهنا اكثر من موقع يقدم هالخدمة وانا بختار (٣)
Primer-BLAST في موقعنا السابق من المهم هنا ان يكون عندي Sequence الجين اللي بطلع منه البرامير فمثلا لو ابي اصنع برايمر لجين N
ل #فيروس_كورونا_المستجدّ راح ابحث اولاً عن sequence N وراح ارجع للموقع السابق وبكتب Covid19 في البحث وفي جنب مستطيل البحث خيارات نختار Neclotide(٤)
ل #فيروس_كورونا_المستجدّ راح ابحث اولاً عن sequence N وراح ارجع للموقع السابق وبكتب Covid19 في البحث وفي جنب مستطيل البحث خيارات نختار Neclotide(٤)
الان بتظهرلنا نتائج كثيرة نختار اللي يناسبنا انا اخترت الاول نضغط عليه بتطلع لي صفحة انا هنا اركز على شغلة كلمة Gene
بحصل جنبها اسم الجين اللي ابيه اللي هو N اضغط على كلمة Gene (كما في الصورة)بعدها انزل تحت يمين واختار Fasta (كما في الصورة)الان نقلني صفحة جديدة(٥)
بحصل جنبها اسم الجين اللي ابيه اللي هو N اضغط على كلمة Gene (كما في الصورة)بعدها انزل تحت يمين واختار Fasta (كما في الصورة)الان نقلني صفحة جديدة(٥)
الان بنسخ الجين وبروح اعمل البرايمر اروح للرابط الاتي
فيه مستطيل الصق فيه اللي نسخته واراعي عدم وجود مسافات فوق وتحت
بعدها اضغط تحت Get Primer الان نقلني صفحة جديدة وفيها 10 برايمرات تبدأ من اول الجين الى نهايته وفيه رسم جرافيكس يبين لك كل برايمر(٦)
فيه مستطيل الصق فيه اللي نسخته واراعي عدم وجود مسافات فوق وتحت
بعدها اضغط تحت Get Primer الان نقلني صفحة جديدة وفيها 10 برايمرات تبدأ من اول الجين الى نهايته وفيه رسم جرافيكس يبين لك كل برايمر(٦)
وين موقعه في الجين،راح انسخ البرايمر اللي ابي اطلبه الان البرايمر عندنا ونبي نطلبه انا شخصيا جربت هالموقع اكثرمن مره وسريع في التوصيل eu.idtdna.com بعد التسجيل , طبعا على فرضية ان البرايمر اللي بتطلبه بيكون لااغراض بحثيه او تشخيصية،نروح لااول خيار PRODUCTS & SERVICES(٧)
بعدها نختار اول خيار Custom DNA oligos
بعدها نختار order in tube ونلصق البرايمر اللي نسخناه
فوق بيكون معنا name وهو الاسم اللي بيجينا ومكتوب عليه اسم البرايمر مثلا N gene وتحت في المستطيل ننسخ البرايمر اللي عملناه ونكمل نكتب العنوان وندفع , طريقة solution (٨)
بعدها نختار order in tube ونلصق البرايمر اللي نسخناه
فوق بيكون معنا name وهو الاسم اللي بيجينا ومكتوب عليه اسم البرايمر مثلا N gene وتحت في المستطيل ننسخ البرايمر اللي عملناه ونكمل نكتب العنوان وندفع , طريقة solution (٨)
للبرايمر بنشوف مكتوب عليه od ورقم جنبه
مثلا od18.1 هنا نضرب هذا الرقم في 10 والكمية اللي طالعه معنا نضيف منها H2O يعني بمثالنا السابق بتكون 181 من Neclous free water (٩)
انتهى وشكرا لكم
مثلا od18.1 هنا نضرب هذا الرقم في 10 والكمية اللي طالعه معنا نضيف منها H2O يعني بمثالنا السابق بتكون 181 من Neclous free water (٩)
انتهى وشكرا لكم
جاري تحميل الاقتراحات...