Baraa Alhajhussein
Baraa Alhajhussein

@AboSohaib

8 تغريدة 5 قراءة Aug 04, 2021
اتتني تساؤلات عن طرق أخرى يمكن استخدامها عدا تفاعل البلمرة التسلسلي
Polymerase Chain Reaction #PCR
والذي يمر ب 35-40 سلسلة متكررة من مراحل التفاعل
1. فصل شريطي #DNA المتقابلين
Denaturation 92°C
2. الارتباط بممهد التضاعف
Primer annealing 52-66°C
3.نسخ الامتداد
Extension 70°C
اولها كتفاعل شبيه وليس اولا تاريخيا
ظهرت تقنية LCR Ligase Chain Reaction المكملة ل PCR في اواسط التسعينات برعاية شركة #Abbott لكن سرعان ما اختفت من التطبيقات التشخيصية
وذلك لانها في الاساس لتشخيص الطفرات المفردة point mutation ثم دخلت مجال التشخيص كتقنية مكملة ل PCR
وذلك لرفع دقة ارتباطligation specificity لعديدات القواعد النووية oligonucleotides قبل إجراء PCR
لانها تعتمد على ان خطوة ligation الاولى مبرمجة بإنزيم خاص thermostable ligase
بدلا من الارتباط العفوي اعتمادا على تخفيض درجة حرارة التفاعل قريبا من نقطة ذوبان الشريط Melting point
ثانيا
اغلب التقنيات الأخرى المنتشرة الآن لاتعتمد التسلسل الحراري صعودا ونزولا على المراحل الثلاث كما PCR
بل تتمحور حول
Isothermal amplification
حيث ان مضاعفة نسخ جديدة تتم في درجة حرارة ثابتة في جميع الفحوصات من ذلك النوع
60-65°C
مما يجعل الاجهزة ارخص سعرا والتحليل اسرع وقتا
ساسرد هذه التقنيات سردا وعلى الراغب في التوسع ان يبحث بنفسه
سارتبها من وجهة نظري حسب تاريخ دخولها السوق وقوة حضورها في المختبرات التشخيصية
Transcription Mediated Amplification (TMA)
Nucleic Acid Sequence-Based Amplification (NASBA)
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP)
Strand Displacement Amplification (SDA),
Whole Genome Amplification/Multiple Displacement Amplification (WGA/MDA)
Recombinant Polymerase Amplification (RPA)
Helicase Dependant Amplification (HDA)
واخيرا وليس آخرا
Signal Mediated Amplification (SMA) of RNA
international.neb.com
ومع كونها ارخص سعرا كمواد وأجهزة وابسط تشغيلا واسرع نتيجة
فاعتقد ان اهتمام العلماء والشركات بتفاعل PCR
عائد لاسباب اهمها من وجهة نظري
1. أن معظم دارسي علم الأحياء او المختبرات الطبية في العالم مابعد عام 1990 تعلموا في مناهجهم الدراسية PCR ونادرا جدا من تعلم التقنيات الاخرى
2. باستثناء محاولات منتجي TMA فالتقنيات الاخرى لم تتبناها شركات قوية توفر أجهزة متكاملة الأتمتة وعالية الانتاج لتوفير 600 نتيجة يوميا على الأقل
3.صعوبة تطوير تطبيقاته ابتداءا مقارنة ب PCR
للتوسع في المزايا والتحديات انصح بقراءة
link.springer.com
كما ارجو إبداء ملاحظاتكم

جاري تحميل الاقتراحات...